Мое скромное мнение: Инструмент есть совокупность конструктивных особенностей (вкл вытекающий звук), техники игры и репертуара.
"Традиционный" баян - строением отличается разве что басами (правда у немцев есть из той же оперы helikon-bass). На баяне регистров не было, а на аккордеоне были. И голоса были настроены в унисон, что необычно для традиционного аккордеона (да, да, на балканах были в моде сухие аккордеоны, но это скорее исключение).
Своя школа игры формировалась исторически на трехрядной клавиатуре (несмотря на то, что в европе пятирядки были еще до войны). И школа игры сформировалась серьезная. Хотя, да, в Голландии и Бельгии тоже играли на Б-грифе, и тоже пальцами правой руки, тобишь техника была та же.
Репертаур, именно для баяна, сформировался огромный.
Итого, когда мы говорим "баян", то сразу возникает представление о том, как он устроен, как звучит, какую музыку (и как) на нем играют. При словах "аккордеон", "гармонь" представляются другоие инструменты со своим звуком и репертуаром.
И исторически он, все-таки заслуживает статус отдельного инструмента.
Современный концертный баян играет (почти) тот же репертуар, что и современный концертный аккордеон - разница в клавиатуре и расширенном диапазоне правой клавы "баяна" супротив аккордеона.